Grandes fragmentos de ADN pueden ser clonados en vectores que contengan los componentes necesarios para propagarse como cromosomas artificiales en las bacterias. De esta manera, se pueden clonar fragmentos de ADN que tengan de 100.000 a 200.000 pares de bases, como BACs (por sus siglas en inglés). El ADN clonado en los BACs es por lo general más pequeño. Sin embargo, los BACs ofrecen ventajas importantes como por ejemplo, son más manipulables para ciertos tipos de estudios en el laboratorio. Los BACs se usan a gran escala para construir mapas físicos de alta resolución de los cromosomas humanos, con el fin de establecer la secuencia completa del genoma humano.

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