Los microarreglos hacen posible comparar la expresión relativa de miles de genes en las células cancerosas y normales midiendo la intensidad y el color de la fluorescencia de cada sitio. Un programa de computadora (ordenador) puede entonces analizar los datos y hacer mediciones precisas de los genes expresados a niveles altos y a niveles bajos. La mayoría de los estudios de microarreglos ahora incluyen "análisis en racimo", el cual agrupa a los genes que tienen niveles similares de expresión.
![Interpretando los Datos](https://webarchive.library.unt.edu/eot2008/20090201124656im_/http://newscenter.cancer.gov/images/Documents/587f3066-9d97-4149-b914-dd021f56958b/slide15.jpg)
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