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Los virus
salvajes del sarampión se han dividido en distintos grupos genéticos
de acuerdo con las secuencias del nucleotido de sus genes de hemaglutinina
(H) y nucleoproteína (N), que son los genes más variables
en el genoma viral.
La secuencia
del nucleotido que codifica el término
carboxi de la nucleoproteína  (text-only) (los
últimos 450 nucleotidos) contiene hasta el 12% de variación
de nucleotido entre los genotipos más disimilares.
Para cada
agrupamiento genético o genotipo, se designa una
cepa de referencia para ser (text-only)
usado en los análisis genéticos (análisis filogenéticos),
usualmente el primer aislamiento viral que se hizo para ese grupo. Se
ha estandarizado la manera de referirse a los genotipos usando designaciones
alfabéticas para los agrupamientos principales (clades). Dentro
de los grupos principales, se agregan numerales para los distintos grupos
que estén estrechamente relacionados o que se encuentren en el
futuro, a medida que se secuencien más virus.
Se han
aislado los virus con los siguientes genotipos desde 1990:
A, B3,
C1, C2, D2, D3, D4, D5, D6, D7, D8, D9 G2, G3, H1, H2, B2, D10
Lista
de citación de artículos de publicaciones (text-only) sobre
genotipos y secuencias del sarampión.
Se han
desarrollado guías generales para nombrar
cepas o secuencias de manera que todos los investigadores puedan aplicar
una denominación genética y un protocolo de análisis
consistentes al comunicar los datos sobre los virus del sarampión. National
Center for Biotechnology Information (NCBI) (exit site) Genbank
Este enlace abre la ventana de un nuevo examinador, y lo saca del sitio
de los CDC.
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