公民投票案投票结果，投票人数达到投票权人总数二分之一以上，而且有效投票数超过二分之一同意者，即为通过；投票人数不足上述规定数额或未有有效投票数超过二分之一同意者，则为否决。
| | | 有效票数 | 无效票数 | 投票人数 | 投票權人數 | 投票率% | |
| 5,529,230
(94.01%) | 352,359
(5.99%) | 5,881,589 | 320,088 | | 17,313,854 | 35.82 | 否决 |
返联 (第六案) | 4,962,309
(87.27%) | 724,060
(12.73%) | 5,686,369 | 500,749 | | 17,313,854 | 35.74 | |
第五案：1971年中华人民共和国进入联合国，取代中华民国，台湾成为国际孤儿。为强烈表达台湾人民的意志，提升台湾的国际地位及参与，您是否同意政府以台湾名义加入联合国？
第六案：您是否同意我国申请重返联合国及加入其它组织，名称采务实、有弹性的策略，亦即赞成以中华民国名义、或以台湾名义、或以其他有助于成功并兼顾尊严的名称，申请重返联合国及加入其他国际组织？
