Algunas veces una persona con un alelo dominante expresará un rasgo distintivo, sin embargo ese mismo genotipo en otra persona permanecerá silencioso. Éste es un ejemplo de diferencias en penetración. En la genética clásica Mendeliana, si una persona porta un alelo dominante, el rasgo distintivo será expresado (genotipo = fenotipo). Sin embargo, si todos los portadores de un cierto alelo dominante en una población no expresan el rasgo distintivo (mismos genotipos/diferentes fenotipos), se dice que el gen tiene penetración incompleta.