CGAP       the Cancer Genome Anatomy Project
    CGAP HOW TO GenesChromosomesTissuesSAGEPathwaysTools  

Tissues

Tools

CGAP Data

Purchase CGAP Reagents

Overviews

Related Links

Quick Links:

NCI Logo


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.351279Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerPNormalCancerP
ALL TISSUES 234 / 3362197 152 / 2519110 3421 / 72138110 2948 / 81510018 234 / 3362197 152 / 2519110 0.09 3421 / 72138110 2948 / 81510018 0.00
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 10014 -- -- -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 290 -- -- -- --
bone 3 / 16167 1 / 58015 -- 9 / 83577 3 / 16167 1 / 58015 0.097 -- 9 / 83577 --
bone marrow 7 / 14921   1273 / 5047110 2047 / 4978364 7 / 14921 0 / 30151 0.006 1273 / 5047110 2047 / 4978364 0.000
brain 4 / 510966 13 / 201729 2 / 729526 96 / 4997811 4 / 510966 13 / 201729 0.000 2 / 729526 96 / 4997811 0.000
cartilage   5 / 37234 -- 8 / 778035 0 / 16098 5 / 37234 0.175 -- 8 / 778035 --
cerebellum       6 / 1495938 0 / 91823 0 / 2 -- 0 / 90885 6 / 1495938 0.396
cerebrum 1 / 202396   -- -- 1 / 202396 0 / 3424 0.494 -- -- --
cervix   1 / 44543 -- -- 0 / 3908 1 / 44543 0.473 -- -- --
colon   9 / 153695   8 / 643586 0 / 26942 9 / 153695 0.199 0 / 98089 8 / 643586 0.244
ear   -- -- -- 0 / 16373 -- -- -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 249307 0 / 41 -- -- -- --
endocrine 2 / 19752 5 / 2921 -- -- 2 / 19752 5 / 2921 0.008 -- -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17337 -- -- -- --
eye 7 / 130687 1 / 46532   77 / 12434232 7 / 130687 1 / 46532 0.259 0 / 85898 77 / 12434232 0.347
gastrointestinal tract       -- 0 / 29121 0 / 12811 -- 0 / 45908 -- --
heart 1 / 77218   1 / 83063 -- 1 / 77218 0 / 1 0.500 1 / 83063 -- --
kidney 1 / 107595 9 / 90516 2 / 106467 2 / 100281 1 / 107595 9 / 90516 0.015 2 / 106467 2 / 100281 0.487
limb -- -- -- -- -- -- -- -- -- --
liver   3 / 107929   2 / 214987 0 / 99196 3 / 107929 0.181 0 / 66308 2 / 214987 0.367
lung 45 / 129050 28 / 172991 4 / 159917 30 / 159059 45 / 129050 28 / 172991 0.001 4 / 159917 30 / 159059 0.000
lymph node 5 / 64720 11 / 27087 1164 / 5278419 64 / 4863489 5 / 64720 11 / 27087 0.004 1164 / 5278419 64 / 4863489 0.000
lymphoreticular 11 / 17864 2 / 44399 -- -- 11 / 17864 2 / 44399 0.000 -- -- --
mammary gland 9 / 47846 6 / 106092 20 / 1190522 69 / 2230209 9 / 47846 6 / 106092 0.031 20 / 1190522 69 / 2230209 0.008
muscle 5 / 75808   1 / 107836 2 / 61270 5 / 75808 0 / 27676 0.199 1 / 107836 2 / 61270 0.287
nervous     -- -- 0 / 10475 0 / 9 -- -- -- --
ovary 1 / 11589 4 / 91020 1 / 94887 8 / 179472 1 / 11589 4 / 91020 0.403 1 / 94887 8 / 179472 0.130
pancreas 2 / 7325 2 / 74666   8 / 189999 2 / 7325 2 / 74666 0.142 0 / 85728 8 / 189999 0.081
pancreatic islet 4 / 98315   -- -- 4 / 98315 0 / 30307 0.265 -- -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20606 -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 15119   -- -- 2 / 15119 0 / 693 0.470 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6353 -- -- -- -- --
pituitary gland 1 / 13420   -- -- 1 / 13420 0 / 1392 0.469 -- -- --
placenta 7 / 241804 1 / 39596   -- 7 / 241804 1 / 39596 0.451 0 / 207348 -- --
pooled tissue 59 / 283880   -- -- 59 / 283880 0 / 0 -- -- -- --
prostate 7 / 81054 5 / 107295 2 / 266949 10 / 491794 7 / 81054 5 / 107295 0.204 2 / 266949 10 / 491794 0.138
retina 4 / 30295 -- 2 / 820326   4 / 30295 -- -- 2 / 820326 0 / 88490 0.438
salivary gland     -- -- 0 / 2515 0 / 10362 -- -- -- --
skin   2 / 125554 375 / 26905847 447 / 34522313 0 / 74229 2 / 125554 0.306 375 / 26905847 447 / 34522313 0.148
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- -- -- --
spleen     -- -- 0 / 53613 0 / 5 -- -- -- --
stem cell -- -- 31 / 6230144 -- -- -- -- 31 / 6230144 -- --
stomach 2 / 26999 4 / 66649   8 / 448716 2 / 26999 4 / 66649 0.451 0 / 124767 8 / 448716 0.148
synovium     -- -- 0 / 254 0 / 1713 -- -- -- --
testis 2 / 146291   -- 44 / 12372003 2 / 146291 0 / 100465 0.291 -- 44 / 12372003 --
thymus     -- -- 0 / 4522 0 / 169 -- -- -- --
thyroid 1 / 12032 4 / 33610 1 / 115938 3 / 124664 1 / 12032 4 / 33610 0.412 1 / 115938 3 / 124664 0.288
uncharacterized tissue 35 / 209288 18 / 485211     35 / 209288 18 / 485211 0.000 0 / 21833 0 / 51729 --
uterus 5 / 38245 18 / 134355 135 / 10193077 -- 5 / 38245 18 / 134355 0.464 135 / 10193077 -- --
vascular 1 / 46528 -- 5 / 13135050 -- 1 / 46528 -- -- 5 / 13135050 -- --
white blood cells -- -- 402 / 846268 -- -- -- -- 402 / 846268 -- --
whole body -- -- -- -- -- -- -- -- -- --

If you have any questions, comments, or need information about CGAP, please contact the NCI CGAP Help Desk.