CGAP       the Cancer Genome Anatomy Project
    CGAP HOW TO GenesChromosomesTissuesSAGEPathwaysTools  

Tissues

Tools

CGAP Data

Purchase CGAP Reagents

Overviews

Related Links

Quick Links:

NCI Logo


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.508423Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerPNormalCancerP
ALL TISSUES 84 / 3362197 212 / 2519110 474 / 72138110 1381 / 81510018 84 / 3362197 212 / 2519110 0.00 474 / 72138110 1381 / 81510018 0.00
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 10014 -- -- -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 290 -- -- -- --
bone   2 / 58015 --   0 / 16167 2 / 58015 0.376 -- 0 / 83577 --
bone marrow     28 / 5047110 848 / 4978364 0 / 14921 0 / 30151 -- 28 / 5047110 848 / 4978364 0.000
brain 10 / 510966 9 / 201729 10 / 729526 64 / 4997811 10 / 510966 9 / 201729 0.074 10 / 729526 64 / 4997811 0.453
cartilage 1 / 16098   -- 17 / 778035 1 / 16098 0 / 37234 0.315 -- 17 / 778035 --
cerebellum     1 / 90885 18 / 1495938 0 / 91823 0 / 2 -- 1 / 90885 18 / 1495938 0.455
cerebrum     -- -- 0 / 202396 0 / 3424 -- -- -- --
cervix     -- -- 0 / 3908 0 / 44543 -- -- -- --
colon   2 / 153695 1 / 98089 10 / 643586 0 / 26942 2 / 153695 0.410 1 / 98089 10 / 643586 0.377
ear   -- -- -- 0 / 16373 -- -- -- -- --
embryonic tissue 6 / 249307   -- -- 6 / 249307 0 / 41 0.500 -- -- --
endocrine     -- -- 0 / 19752 0 / 2921 -- -- -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17337 -- -- -- --
eye 1 / 130687 1 / 46532 1 / 85898 71 / 12434232 1 / 130687 1 / 46532 0.381 1 / 85898 71 / 12434232 0.391
gastrointestinal tract 1 / 29121 2 / 12811 1 / 45908 -- 1 / 29121 2 / 12811 0.251 1 / 45908 -- --
heart 3 / 77218     -- 3 / 77218 0 / 1 0.500 0 / 83063 -- --
kidney 10 / 107595 10 / 90516     10 / 107595 10 / 90516 0.373 0 / 106467 0 / 100281 --
limb -- -- -- -- -- -- -- -- -- --
liver   1 / 107929   8 / 214987 0 / 99196 1 / 107929 0.368 0 / 66308 8 / 214987 0.132
lung 9 / 129050 5 / 172991 5 / 159917 2 / 159059 9 / 129050 5 / 172991 0.096 5 / 159917 2 / 159059 0.213
lymph node     25 / 5278419 1 / 4863489 0 / 64720 0 / 27087 -- 25 / 5278419 1 / 4863489 0.000
lymphoreticular   1 / 44399 -- -- 0 / 17864 1 / 44399 0.416 -- -- --
mammary gland   1 / 106092 21 / 1190522 39 / 2230209 0 / 47846 1 / 106092 0.410 21 / 1190522 39 / 2230209 0.497
muscle 3 / 75808   1 / 107836 2 / 61270 3 / 75808 0 / 27676 0.293 1 / 107836 2 / 61270 0.287
nervous     -- -- 0 / 10475 0 / 9 -- -- -- --
ovary 1 / 11589 4 / 91020   3 / 179472 1 / 11589 4 / 91020 0.403 0 / 94887 3 / 179472 0.248
pancreas   2 / 74666 2 / 85728 2 / 189999 0 / 7325 2 / 74666 0.443 2 / 85728 2 / 189999 0.331
pancreatic islet     -- -- 0 / 98315 0 / 30307 -- -- -- --
parathyroid   4 / 20606 -- -- 0 / 24 4 / 20606 0.498 -- -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 15119 0 / 693 -- -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6353 -- -- -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13420 0 / 1392 -- -- -- --
placenta     2 / 207348 -- 0 / 241804 0 / 39596 -- 2 / 207348 -- --
pooled tissue 8 / 283880   -- -- 8 / 283880 0 / 0 -- -- -- --
prostate 19 / 81054 105 / 107295 7 / 266949 5 / 491794 19 / 81054 105 / 107295 0.000 7 / 266949 5 / 491794 0.103
retina   -- 10 / 820326   0 / 30295 -- -- 10 / 820326 0 / 88490 0.258
salivary gland     -- -- 0 / 2515 0 / 10362 -- -- -- --
skin 2 / 74229 1 / 125554 144 / 26905847 213 / 34522313 2 / 74229 1 / 125554 0.293 144 / 26905847 213 / 34522313 0.094
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- -- -- --
spleen     -- -- 0 / 53613 0 / 5 -- -- -- --
stem cell -- -- 38 / 6230144 -- -- -- -- 38 / 6230144 -- --
stomach   36 / 66649 1 / 124767 15 / 448716 0 / 26999 36 / 66649 0.000 1 / 124767 15 / 448716 0.104
synovium     -- -- 0 / 254 0 / 1713 -- -- -- --
testis 3 / 146291 5 / 100465 -- 61 / 12372003 3 / 146291 5 / 100465 0.188 -- 61 / 12372003 --
thymus     -- -- 0 / 4522 0 / 169 -- -- -- --
thyroid   1 / 33610 3 / 115938 2 / 124664 0 / 12032 1 / 33610 0.422 3 / 115938 2 / 124664 0.368
uncharacterized tissue 3 / 209288 18 / 485211     3 / 209288 18 / 485211 0.079 0 / 21833 0 / 51729 --
uterus 3 / 38245 2 / 134355 79 / 10193077 -- 3 / 38245 2 / 134355 0.135 79 / 10193077 -- --
vascular 1 / 46528 -- 89 / 13135050 -- 1 / 46528 -- -- 89 / 13135050 -- --
white blood cells -- -- 5 / 846268 -- -- -- -- 5 / 846268 -- --
whole body -- -- -- -- -- -- -- -- -- --

If you have any questions, comments, or need information about CGAP, please contact the NCI CGAP Help Desk.