CGAP       the Cancer Genome Anatomy Project
    CGAP HOW TO GenesChromosomesTissuesSAGEPathwaysTools  

Tissues

Tools

CGAP Data

Purchase CGAP Reagents

Overviews

Related Links

Quick Links:

NCI Logo


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.22393Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerPNormalCancerP
ALL TISSUES 174 / 3362197 147 / 2519110 1245 / 72138110 1558 / 81510018 174 / 3362197 147 / 2519110 0.15 1245 / 72138110 1558 / 81510018 0.00
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 10014 -- -- -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 290 -- -- -- --
bone   3 / 58015 -- 2 / 83577 0 / 16167 3 / 58015 0.324 -- 2 / 83577 --
bone marrow 1 / 14921 2 / 30151 68 / 5047110 225 / 4978364 1 / 14921 2 / 30151 0.505 68 / 5047110 225 / 4978364 0.000
brain 18 / 510966 8 / 201729 31 / 729526 208 / 4997811 18 / 510966 8 / 201729 0.421 31 / 729526 208 / 4997811 0.476
cartilage   3 / 37234 -- 13 / 778035 0 / 16098 3 / 37234 0.273 -- 13 / 778035 --
cerebellum     12 / 90885 78 / 1495938 0 / 91823 0 / 2 -- 12 / 90885 78 / 1495938 0.010
cerebrum 5 / 202396   -- -- 5 / 202396 0 / 3424 0.471 -- -- --
cervix   3 / 44543 -- -- 0 / 3908 3 / 44543 0.424 -- -- --
colon 1 / 26942 11 / 153695 4 / 98089 39 / 643586 1 / 26942 11 / 153695 0.312 4 / 98089 39 / 643586 0.233
ear   -- -- -- 0 / 16373 -- -- -- -- --
embryonic tissue 41 / 249307   -- -- 41 / 249307 0 / 41 0.498 -- -- --
endocrine     -- -- 0 / 19752 0 / 2921 -- -- -- --
esophagus   1 / 17337 -- -- 0 / 270 1 / 17337 0.495 -- -- --
eye 9 / 130687 2 / 46532 2 / 85898 61 / 12434232 9 / 130687 2 / 46532 0.311 2 / 85898 61 / 12434232 0.168
gastrointestinal tract 1 / 29121 2 / 12811 4 / 45908 -- 1 / 29121 2 / 12811 0.251 4 / 45908 -- --
heart 6 / 77218   2 / 83063 -- 6 / 77218 0 / 1 0.500 2 / 83063 -- --
kidney 3 / 107595 7 / 90516 3 / 106467   3 / 107595 7 / 90516 0.121 3 / 106467 0 / 100281 0.179
limb -- -- -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 99196 5 / 107929 2 / 66308 11 / 214987 2 / 99196 5 / 107929 0.234 2 / 66308 11 / 214987 0.283
lung 4 / 129050 7 / 172991 6 / 159917 5 / 159059 4 / 129050 7 / 172991 0.365 6 / 159917 5 / 159059 0.410
lymph node 5 / 64720   108 / 5278419 15 / 4863489 5 / 64720 0 / 27087 0.180 108 / 5278419 15 / 4863489 0.000
lymphoreticular 2 / 17864   -- -- 2 / 17864 0 / 44399 0.174 -- -- --
mammary gland 5 / 47846 6 / 106092 35 / 1190522 120 / 2230209 5 / 47846 6 / 106092 0.232 35 / 1190522 120 / 2230209 0.001
muscle 6 / 75808 1 / 27676 1 / 107836 6 / 61270 6 / 75808 1 / 27676 0.299 1 / 107836 6 / 61270 0.032
nervous     -- -- 0 / 10475 0 / 9 -- -- -- --
ovary   5 / 91020 5 / 94887 12 / 179472 0 / 11589 5 / 91020 0.342 5 / 94887 12 / 179472 0.344
pancreas   1 / 74666 3 / 85728 11 / 189999 0 / 7325 1 / 74666 0.471 3 / 85728 11 / 189999 0.255
pancreatic islet 9 / 98315 2 / 30307 -- -- 9 / 98315 2 / 30307 0.363 -- -- --
parathyroid   3 / 20606 -- -- 0 / 24 3 / 20606 0.499 -- -- --
peripheral nervous system 1 / 15119   -- -- 1 / 15119 0 / 693 0.485 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6353 -- -- -- -- --
pituitary gland 1 / 13420   -- -- 1 / 13420 0 / 1392 0.469 -- -- --
placenta 12 / 241804 3 / 39596 10 / 207348 -- 12 / 241804 3 / 39596 0.345 10 / 207348 -- --
pooled tissue 10 / 283880   -- -- 10 / 283880 0 / 0 -- -- -- --
prostate 5 / 81054 4 / 107295 7 / 266949 14 / 491794 5 / 81054 4 / 107295 0.291 7 / 266949 14 / 491794 0.429
retina   -- 38 / 820326 3 / 88490 0 / 30295 -- -- 38 / 820326 3 / 88490 0.307
salivary gland     -- -- 0 / 2515 0 / 10362 -- -- -- --
skin 5 / 74229 7 / 125554 445 / 26905847 582 / 34522313 5 / 74229 7 / 125554 0.410 445 / 26905847 582 / 34522313 0.380
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- -- -- --
spleen     -- -- 0 / 53613 0 / 5 -- -- -- --
stem cell -- -- 36 / 6230144 -- -- -- -- 36 / 6230144 -- --
stomach   3 / 66649 9 / 124767 29 / 448716 0 / 26999 3 / 66649 0.281 9 / 124767 29 / 448716 0.419
synovium     -- -- 0 / 254 0 / 1713 -- -- -- --
testis 9 / 146291 10 / 100465 -- 118 / 12372003 9 / 146291 10 / 100465 0.191 -- 118 / 12372003 --
thymus     -- -- 0 / 4522 0 / 169 -- -- -- --
thyroid   1 / 33610 13 / 115938 4 / 124664 0 / 12032 1 / 33610 0.422 13 / 115938 4 / 124664 0.024
uncharacterized tissue 7 / 209288 38 / 485211   2 / 51729 7 / 209288 38 / 485211 0.019 0 / 21833 2 / 51729 0.339
uterus 3 / 38245 9 / 134355 312 / 10193077 -- 3 / 38245 9 / 134355 0.451 312 / 10193077 -- --
vascular 1 / 46528 -- 59 / 13135050 -- 1 / 46528 -- -- 59 / 13135050 -- --
white blood cells -- -- 30 / 846268 -- -- -- -- 30 / 846268 -- --
whole body -- -- -- -- -- -- -- -- -- --

If you have any questions, comments, or need information about CGAP, please contact the NCI CGAP Help Desk.