CGAP       the Cancer Genome Anatomy Project
    CGAP HOW TO GenesChromosomesTissuesSAGEPathwaysTools  

Tissues

Tools

CGAP Data

Purchase CGAP Reagents

Overviews

Related Links

Quick Links:

NCI Logo


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.386883Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerPNormalCancerP
ALL TISSUES 74 / 3247260 36 / 407037 187 / 25718729 1 / 491920 74 / 3247260 36 / 407037 0.00 187 / 25718729 1 / 491920 0.11
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38540 -- -- 0 / 64924 -- --
bone marrow   --   -- 0 / 103201 -- -- 0 / 103390 -- --
brain 7 / 261712   70 / 7554651 -- 7 / 261712 0 / 2128 0.480 70 / 7554651 -- --
cartilage   -- -- -- 0 / 229 -- -- -- -- --
cerebellum 3 / 54094 -- 1 / 233710   3 / 54094 -- -- 1 / 233710 0 / 43127 0.451
cerebrum 3 / 226915 -- -- -- 3 / 226915 -- -- -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51579 0 / 701 -- -- -- --
ear 6 / 40228 -- -- -- 6 / 40228 -- -- -- -- --
embryonic tissue 17 / 712449   27 / 2760977 -- 17 / 712449 0 / 9949 0.425 27 / 2760977 -- --
endocrine   -- -- -- 0 / 2227 -- -- -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- -- 0 / 211918 -- --
eye 2 / 94711 --   -- 2 / 94711 -- -- 0 / 138066 -- --
gastrointestinal tract   -- 6 / 548222 -- 0 / 34096 -- -- 6 / 548222 -- --
heart   -- 7 / 1231698 -- 0 / 48964 -- -- 7 / 1231698 -- --
kidney 1 / 121630   8 / 1415985 -- 1 / 121630 0 / 2222 0.494 8 / 1415985 -- --
limb   -- 10 / 595880 -- 0 / 16422 -- -- 10 / 595880 -- --
liver     1 / 527425 -- 0 / 104438 0 / 5979 -- 1 / 527425 -- --
lung 1 / 25689 11 / 73371 3 / 943009 -- 1 / 25689 11 / 73371 0.133 3 / 943009 -- --
lymph node   -- 4 / 344354 -- 0 / 15186 -- -- 4 / 344354 -- --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3163 0 / 5449 -- -- -- --
mammary gland 1 / 85945 25 / 219430 2 / 960632   1 / 85945 25 / 219430 0.005 2 / 960632 0 / 178606 0.406
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24410 -- -- 1 / 137075 -- --
nervous 2 / 34051 -- -- -- 2 / 34051 -- -- -- -- --
ovary 1 / 43039 -- 3 / 354066 -- 1 / 43039 -- -- 3 / 354066 -- --
pancreas     20 / 1338446 -- 0 / 75835 0 / 36 -- 20 / 1338446 -- --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30482 -- -- -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9649 -- -- -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3926 -- -- -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17468 -- -- 0 / 145854 -- --
placenta 3 / 36994 --   -- 3 / 36994 -- -- 0 / 292212 -- --
pooled tissue 4 / 101540 -- -- -- 4 / 101540 -- -- -- -- --
prostate     1 / 386047 -- 0 / 24084 0 / 5 -- 1 / 386047 -- --
retina 1 / 84962 -- 7 / 636203 -- 1 / 84962 -- -- 7 / 636203 -- --
salivary gland     -- -- 0 / 18512 0 / 960 -- -- -- --
skin 7 / 85388   4 / 615945   7 / 85388 0 / 31765 0.130 4 / 615945 0 / 57574 0.397
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 76034 0 / 17823 -- 0 / 386635 -- --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- -- 1 / 234473 -- --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 19793 -- -- 1 / 218318 -- --
synovium 1 / 17023 -- -- -- 1 / 17023 -- -- -- -- --
testis     1 / 736319 -- 0 / 113322 0 / 2677 -- 1 / 736319 -- --
thymus 3 / 100585   1 / 346181 -- 3 / 100585 0 / 20374 0.357 1 / 346181 -- --
thyroid 1 / 8891 -- -- -- 1 / 8891 -- -- -- -- --
uncharacterized tissue 9 / 261123     -- 9 / 261123 0 / 14168 0.365 0 / 25954 -- --
uterus 1 / 6932 -- 4 / 206823 -- 1 / 6932 -- -- 4 / 206823 -- --
vascular   -- 2 / 1092595 -- 0 / 11799 -- -- 2 / 1092595 -- --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- -- 1 / 398838 -- --
whole body -- -- 1 / 531904 1 / 212613 -- -- -- 1 / 531904 1 / 212613 0.393

If you have any questions, comments, or need information about CGAP, please contact the NCI CGAP Help Desk.